La crypte, construite dans les années 1100, était à l'origine composée de trois parties se terminant par un chevet plat. Lors de l'ajout du chœur gothique à l'église, une seule partie supplémentaire a été ajoutée à la partie romane pour soutenir le nouveau chœur, le protégeant ainsi des crues de la rivière voisine. Les différences de style entre les parties romane et gothique sont visibles dans les voûtes et les chapiteaux. Un bel escalier du XVIe siècle, marqué par un arc en accolade, mène à la crypte, dont la voûte conserve des traces de polychromie du XIXe siècle. La salle intermédiaire menant au cloître, probablement une sacristie remaniée au XIIIe siècle, a perturbé le mur nord de la crypte romane.